Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnnm2Q3TWN3 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms