Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC173482.3-201ENSMUST00000225492 1212 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 A730018C14Rik-201ENSMUST00000050754 2253 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem260-202ENSMUST00000124720 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms