Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Prr27Q3SYJ2 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms