Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Smrp1Q2MH31 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Smrp1Q2MH31 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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