Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Trim71Q1PSW8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms