Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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ptchd1Q14B62 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ptchd1Q14B62 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms