Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Traf3ip1Q149C2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Traf3ip1Q149C2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Traf3ip1Q149C2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms