Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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VgfQ0VGU4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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VgfQ0VGU4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
VgfQ0VGU4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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VgfQ0VGU4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VgfQ0VGU4 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147 ms