Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp2b3Q0VF55 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp2b3Q0VF55 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms