Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rundc1Q0VDN7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms