Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Shisal1Q0VBP7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms