Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rab42Q0PD08 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rab42Q0PD08 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms