Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vps8Q0P5W1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vps8Q0P5W1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms