Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Znf541Q0GGX2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms