Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gdf3Q07104 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gdf3Q07104 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms