Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Sh3bp2Q06649 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Sh3bp2Q06649 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms