Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scg2Q03517 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms