Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms