Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Runx1Q03347 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms