Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gjb5Q02739 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms