Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms