Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smarcc1P97496 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms