Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cbx1P83917 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms