Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irx1P81068 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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