Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ptprn2P80560 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms