Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Usp9xP70398 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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