Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Msx3P70354 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms