Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Pkn1P70268 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
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Pkn1P70268 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Pkn1P70268 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Pkn1P70268 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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