Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
UbdP63072 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
UbdP63072 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms