Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Acta2P62737 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Acta2P62737 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms