Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Lmo4P61969 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lmo4P61969 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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