Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Itga11P61622 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms