Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pcbp1P60335 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms