Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Csrnp3P59055 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms