Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
P58686 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
P58686 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P58686 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P58686 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms