Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gsc2P56916 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Gsc2P56916 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gsc2P56916 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms