Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rad23aP54726 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms