Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Defa6P50704 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Defa6P50704 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms