Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Lig1P37913 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Lig1P37913 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms