Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddit3P35639 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ddit3P35639 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms