Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Rab5cP35278 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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Rab5cP35278 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Rab5cP35278 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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