Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Usp4P35123 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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