Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cers3-202ENSMUST00000208521 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Olfr768-201ENSMUST00000063031 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC160966.1-201ENSMUST00000217147 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Hoxa2P31245 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms