Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
VtnP29788 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
VtnP29788 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
VtnP29788 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
VtnP29788 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms