Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxraP28700 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxraP28700 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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