Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
NapbP28663 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
NapbP28663 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NapbP28663 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NapbP28663 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms