Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Defa5P28312 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Defa5P28312 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms