Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Psmb9P28076 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms