Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde6aP27664 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Pde6aP27664 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pde6aP27664 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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