Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Col8a2P25318 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Col8a2P25318 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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